MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 29191 plasmid pZZ6.01

Total Repeats: 415

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018146	GAA	2	6	9	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018146	ACG	2	6	171	176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018146	TGCC	2	8	189	196	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018146	GC	3	6	241	246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018146	GC	3	6	258	263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018146	A	7	7	281	287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018146	GCA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018146	GA	3	6	385	390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018146	TGC	2	6	397	402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018146	AATCT	2	10	434	443	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018146	CAA	2	6	488	493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018146	TCA	2	6	531	536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018146	CA	3	6	560	565	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018146	CGA	2	6	594	599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018146	CCGG	2	8	607	614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018146	A	8	8	650	657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018146	AT	3	6	705	710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018146	GAA	2	6	791	796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677587
19	NC_018146	TCC	2	6	957	962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397677587
20	NC_018146	CT	3	6	968	973	0 %	50 %	0 %	50 %	397677587
21	NC_018146	CTG	2	6	1072	1077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677587
22	NC_018146	GAA	2	6	1082	1087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677587
23	NC_018146	T	6	6	1178	1183	0 %	100 %	0 %	0 %	397677587
24	NC_018146	ATCA	2	8	1228	1235	50 %	25 %	0 %	25 %	397677587
25	NC_018146	CAT	2	6	1276	1281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677587
26	NC_018146	TG	3	6	1335	1340	0 %	50 %	50 %	0 %	397677587
27	NC_018146	AC	3	6	1407	1412	50 %	0 %	0 %	50 %	397677587
28	NC_018146	TCA	2	6	1418	1423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677587
29	NC_018146	AATCA	2	10	1544	1553	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_018146	C	8	8	1618	1625	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NC_018146	CAA	2	6	1631	1636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018146	TCA	2	6	1741	1746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018146	TTG	2	6	1884	1889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677588
34	NC_018146	TCT	2	6	1908	1913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677588
35	NC_018146	GATG	2	8	1927	1934	25 %	25 %	50 %	0 %	397677588
36	NC_018146	GAA	2	6	1952	1957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677588
37	NC_018146	TA	3	6	2031	2036	50 %	50 %	0 %	0 %	397677588
38	NC_018146	TTG	2	6	2090	2095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677588
39	NC_018146	CTT	2	6	2199	2204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677588
40	NC_018146	A	6	6	2232	2237	100 %	0 %	0 %	0 %	397677588
41	NC_018146	TGACA	2	10	2305	2314	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018146	T	7	7	2379	2385	0 %	100 %	0 %	0 %	397677589
43	NC_018146	ATC	2	6	2426	2431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677589
44	NC_018146	GAA	2	6	2478	2483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677589
45	NC_018146	GT	3	6	2504	2509	0 %	50 %	50 %	0 %	397677589
46	NC_018146	ATAG	2	8	2664	2671	50 %	25 %	25 %	0 %	397677589
47	NC_018146	AGC	2	6	2743	2748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677590
48	NC_018146	TTG	2	6	2755	2760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677590
49	NC_018146	TTC	2	6	2896	2901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677590
50	NC_018146	GA	3	6	2902	2907	50 %	0 %	50 %	0 %	397677590
51	NC_018146	CTT	2	6	3033	3038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677590
52	NC_018146	T	8	8	3084	3091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018146	GAT	2	6	3108	3113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018146	AAGCTG	2	12	3128	3139	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018146	CTT	2	6	3171	3176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677591
56	NC_018146	TGG	2	6	3227	3232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397677591
57	NC_018146	A	6	6	3271	3276	100 %	0 %	0 %	0 %	397677591
58	NC_018146	TGA	2	6	3281	3286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677591
59	NC_018146	GGTC	2	8	3351	3358	0 %	25 %	50 %	25 %	397677591
60	NC_018146	AGA	2	6	3359	3364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677591
61	NC_018146	T	6	6	3544	3549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018146	CAT	2	6	3599	3604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018146	TCT	2	6	3689	3694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018146	GTT	2	6	3740	3745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018146	TCA	2	6	3746	3751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018146	TCG	2	6	3796	3801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018146	ATC	2	6	3832	3837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018146	TC	6	12	3989	4000	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018146	CTGC	2	8	4025	4032	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018146	GCA	2	6	4061	4066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018146	CAA	2	6	4074	4079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018146	TCCC	2	8	4095	4102	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_018146	ATA	2	6	4154	4159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018146	T	6	6	4164	4169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018146	ACC	2	6	4201	4206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_018146	TTA	2	6	4207	4212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018146	ATAAA	2	10	4217	4226	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018146	ATT	2	6	4235	4240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018146	AATAA	2	10	4252	4261	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018146	TAA	3	9	4282	4290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018146	AT	3	6	4293	4298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018146	T	7	7	4327	4333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018146	A	6	6	4338	4343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018146	T	7	7	4348	4354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018146	T	8	8	4382	4389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018146	ATA	2	6	4396	4401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018146	ATT	3	9	4402	4410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018146	T	6	6	4449	4454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018146	ACC	2	6	4475	4480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_018146	ATT	2	6	4579	4584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018146	T	6	6	4598	4603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018146	T	6	6	4654	4659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018146	ACC	2	6	4688	4693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_018146	GAA	2	6	4694	4699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018146	AGA	2	6	4727	4732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018146	TCTA	2	8	4781	4788	25 %	50 %	0 %	25 %	397677592
97	NC_018146	AGA	2	6	4845	4850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677592
98	NC_018146	AT	3	6	4877	4882	50 %	50 %	0 %	0 %	397677592
99	NC_018146	GGC	2	6	4938	4943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397677592
100	NC_018146	GCT	2	6	4948	4953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677592
101	NC_018146	CAT	2	6	4982	4987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677592
102	NC_018146	TTA	2	6	4988	4993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677592
103	NC_018146	CTT	3	9	5076	5084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677592
104	NC_018146	ATG	2	6	5132	5137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018146	TAA	2	6	5147	5152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018146	TTA	2	6	5183	5188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018146	T	7	7	5258	5264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018146	AAG	2	6	5278	5283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018146	AGG	2	6	5337	5342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018146	ATG	2	6	5399	5404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018146	TGA	2	6	5452	5457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018146	TCT	2	6	5459	5464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018146	C	6	6	5477	5482	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
114	NC_018146	T	6	6	5489	5494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018146	ATC	2	6	5501	5506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018146	TTAT	2	8	5564	5571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018146	AAGA	2	8	5572	5579	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018146	AAG	2	6	5585	5590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018146	GAC	2	6	5609	5614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018146	AC	3	6	5613	5618	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018146	ATTT	2	8	5621	5628	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018146	CAG	2	6	5629	5634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018146	ATT	2	6	5639	5644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018146	TTC	2	6	5670	5675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018146	AAC	2	6	5684	5689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018146	AT	3	6	5710	5715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018146	CTTT	2	8	5750	5757	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_018146	AGCGA	2	10	5773	5782	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_018146	TAT	2	6	5804	5809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018146	GTTA	2	8	5822	5829	25 %	50 %	25 %	0 %	397677593
131	NC_018146	CAT	2	6	5887	5892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677593
132	NC_018146	GTG	2	6	5893	5898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397677593
133	NC_018146	T	7	7	5908	5914	0 %	100 %	0 %	0 %	397677593
134	NC_018146	TGT	2	6	5971	5976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677593
135	NC_018146	TCT	2	6	6053	6058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677593
136	NC_018146	T	6	6	6058	6063	0 %	100 %	0 %	0 %	397677593
137	NC_018146	TAT	2	6	6087	6092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677593
138	NC_018146	TA	3	6	6108	6113	50 %	50 %	0 %	0 %	397677593
139	NC_018146	A	6	6	6136	6141	100 %	0 %	0 %	0 %	397677593
140	NC_018146	T	6	6	6158	6163	0 %	100 %	0 %	0 %	397677593
141	NC_018146	TGG	2	6	6175	6180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397677593
142	NC_018146	T	6	6	6192	6197	0 %	100 %	0 %	0 %	397677593
143	NC_018146	TCC	3	9	6257	6265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397677593
144	NC_018146	GGA	2	6	6274	6279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397677593
145	NC_018146	CTT	2	6	6283	6288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677593
146	NC_018146	ATC	2	6	6379	6384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677593
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.